Sinopsis

Serebii, sebuah Pokémon Legendaris yang dikenal karena kemampuannya untuk menjelajahi waktu, diburu oleh seorang pemburu Pokémon yang tidak diketahui namanya yang ingin menangkapnya. Yukinari, seorang pelatih Pokémon muda yang suka menggambar potret Pokémon, mencoba melindungi Serebii setelah ia tersandung menemuinya; tetapi di tengah pelariannya, keduanya menghilang tanpa jejak. Empat puluh tahun kemudian, pelatih Pokémon ambisius Satoshi berharap bisa melihat Pokémon langka di daerah sekitarnya. White, seorang pengemudi perahu, mengantarkan Satoshi ke desanya. Satoshi ditemani oleh tiga sahabat terdekatnya: Takeshi, mantan pemimpin gym yang sedang berlatih untuk menjadi pembiak Pokémon yang hebat; Kasumi, seorang gadis muda yang ingin menjadi pelatih tipe Air yang terampil; dan Pikachu, mitra Pokémon dan teman pertamanya. Sementara itu, Yukinari dan Serebii muncul kembali di waktu Satoshi dan bertemu dengan kelompoknya. Lord Vicious yang tersembunyi, anggota staf eksekutif terkuat dari Tim Rocket, ingin menangkap Serebii. Menggunakan Dark Ball, varian dari Monster Ball yang merusak Pokémon yang ditangkap dan menarik keluar kekuatan maksimal mereka, Vicious dapat mengubah Pokémon yang tidak bersalah menjadi rintangan yang kuat dan menakutkan—termasuk Serebii itu sendiri! Dihadapkan pada posisi yang sulit, Satoshi, Yukinari, dan teman-temannya harus bekerja sama untuk mengalahkan Vicious dan menyelamatkan Serebii serta diri mereka sendiri.