Sinopsis

Berlokasi di Periode Sengoku, Rantarou, Kirimaru, dan Shinbei adalah siswa muda di Akademi Ninjutsu, sebuah sekolah yang mengajarkan berbagai cara kepada kaum muda untuk menjadi ninja. Dikenal sebagai "Nintamas" (kontraksi dari ninja + tama [telur]), trio utama ini, dan banyak siswa lainnya di sekolah, harus mempelajari berbagai keterampilan unik untuk mencapai tujuan mereka. Sayangnya, semuanya tidak semudah itu, karena para protagonis kita terus-menerus mengalami kegagalan dalam kelas mereka. Dengan guru ninja yang ketat seperti Doi-sensei dan Yamada-sensei, gadis-gadis nakal dari kelas Kunoichi, sekelompok bajak laut, dan banyak karakter menarik lainnya, apapun bisa terjadi di dunia gila Nintama. Setiap episode berdurasi 7 menit 30 detik, dan setiap musim (yang saat ini ada 29) biasanya memiliki rentang 60-90 episode.