Sinopsis

Pada tahun 2999: umat manusia terpecah menjadi dua faksi, Terra dan Ness, dalam perang yang diperjuangkan oleh kapal-kapal bintang. Salah satu pilot terkemuka adalah remaja percaya diri, Yamamoto Yohko, dan selama salah satu misinya, dia dan krunya tersedot ke dalam anomali temporal (seperti di Star Trek) yang mengirimnya kembali ke zaman kita. Amnesia, dia hanya menganggap dirinya sebagai siswa SMA biasa - sampai serangkaian peristiwa mengembalikannya ke kapalnya, TA-29, dengan teman-teman barunya berjuang di sisinya dalam perang yang terlihat mencurigakan seperti permainan arcade (lengkap dengan biaya pengapian 100 yen!).