Sinopsis

Lima belas tahun setelah peristiwa bencana yang dikenal sebagai Second Impact, dunia menghadapi ancaman baru: makhluk surgawi raksasa yang disebut Angels menyerang Tokyo-3 satu per satu. Umat manusia tidak mampu mempertahankan diri melawan Angels meskipun menggunakan amunisi dan taktik militer tercanggih. Satu-satunya harapan untuk keselamatan manusia terletak di tangan NERV, sebuah organisasi misterius yang dipimpin oleh Gendou Ikari yang dingin. NERV mengoperasikan robot humanoid raksasa yang disebut "Evangelions" untuk melawan Angels dengan senjata canggih dan pelindung yang dikenal sebagai Absolute Terror Fields. Bertahun-tahun setelah ditinggalkan oleh ayahnya, Shinji Ikari, putra Gendou yang berusia 14 tahun, kembali ke Tokyo-3. Shinji menjalani pertempuran internal yang terus-menerus melawan trauma mendalam akibat kehilangan ibunya dan pengabaian emosional yang dialaminya dari ayahnya. Takut untuk membuka diri kepada orang lain, hidup Shinji berubah selamanya setelah bertemu dengan Misato Katsuragi yang berusia 29 tahun, seorang petugas NERV berpangkat tinggi yang menunjukkan kepadanya kebaikan maternal yang bebas-jiwa yang belum pernah ia rasakan. Serangan Angel yang menghancurkan memaksa Shinji untuk bertindak saat Gendou mengungkapkan motif sebenarnya untuk mengundang putranya kembali ke Tokyo-3: Shinji adalah satu-satunya anak yang mampu mengemudikan Evangelion Unit-01 secara efisien, robot baru yang disinkronisasikan dengan biometriknya. Meskipun mengalami trauma psikologis yang brutal akibat mengemudikan Evangelion, Shinji membela Tokyo-3 dari ancaman angelik, tanpa menyadari rencana gelap ayahnya.