Sinopsis

Kembali dari liburan musim panas, siswa-siswa Kelas 3-E di Sekolah Menengah Kunugigaoka yang prestisius menemukan diri mereka menghadapi situasi yang tak terhindarkan. Dihadapkan dengan kemungkinan pemusnahan dunia, siswa-siswa harus menemukan cara yang semakin rumit dan kreatif untuk membunuh guru mereka, Koro-sensei, yang licik namun optimis dan suka membantu. Namun, menghilangkan Koro-sensei bukanlah satu-satunya tujuan yang perlu dikhawatirkan siswa-siswa. Gakuhou Asano, kepala sekolah yang kejam dan tanpa ampun, berusaha mencegah keberhasilan Kelas 3-E dengan mencuci otak murid-muridnya yang lain menjadi mesin belajar yang sangat kompetitif. Permusuhan mulai terasa di udara saat pengkhianat dan pembunuh mencoba mengambil hadiah kepala Koro-sensei untuk diri mereka sendiri. Nagisa Shiota, salah satu pembunuh paling terampil di Kelas 3-E, menemukan dirinya di tengah konflik. Sementara ia berusaha mempertahankan prestasi akademisnya dan mencegah akhir dunia, masalah domestik mengancam posisinya di Kelas 3-E. Bersama dengan teman-teman sekelasnya yang berdedikasi, ia kini harus menghadapi ancaman tersebut secara langsung.