Sinopsis

Seratus tahun setelah pergeseran katulistiwa yang katastrofik menyebabkan sebagian besar wilayahnya terendam, Jepang kini berkembang sebagai negara maritim. Kota-kota yang berfungsi tinggi berjajar di pantai Jepang, dan rute laut yang berkembang dengan baik dilindungi oleh kapal-kapal angkatan laut khusus. Industri kelautan berkembang pesat, dan gadis-gadis muda bersemangat untuk bergabung dengan Blue Mermaids—wanita-wanita terampil yang mendedikasikan hidup mereka untuk melindungi lautan. Setelah sekian waktu terpisah, teman masa kecil Akeno Misaki dan Moeka China bertemu kembali di Sekolah Tinggi Laut Gadis Yokosuka. Di sini, mereka bergabung dengan yang lain yang memiliki impian yang sama untuk menjadi Blue Mermaids. Segera, latihan dimulai, dengan Akeno dan Moeka diangkat menjadi pengurus kapal dan kru mereka sendiri. Segala sesuatunya berjalan lancar bagi Akeno saat ia menyesuaikan diri dalam peran sebagai kapten dan menjalin persahabatan antara anggota kru lainnya di atas Harekaze, sebuah kapal perusak. Namun, kegagalan mesin dan navigasi yang tak terduga segera membuat kapal mereka terdampar dan kru dalam bahaya. High School Fleet mengikuti kru Harekaze yang berani saat mereka menjelajahi perairan berbahaya dan rintangan lainnya dalam pencarian mereka untuk menjadi Blue Mermaids yang sepenuhnya terlatih.