Sinopsis

Takashi Natsume dan teman roh-nya, Madara, yang dijuluki "Nyanko," terus mengembalikan nama-nama roh dari Buku Teman yang diberikan oleh neneknya yang telah meninggal, Reiko Natsume. Suatu hari, dalam perjalanan pulang dari sekolah, Takashi bertemu dengan roh yang mengintai bernama Monmonbou, yang mengingat kenangan nenek Takashi setelah mendengar namanya. Rasa ingin tahunya yang alami mendorongnya untuk menjelajahi sebuah kota misterius tempat neneknya dulu tinggal. Berteman dengan kenalan lama neneknya, Yorie Tsumura, dan putra Yorie, Mukuo, Takashi mengungkap lebih banyak tentang masa lalu neneknya. Sementara itu, Nyanko menyimpang untuk mencari makanan dan secara tidak sengaja menemukan "Benih Roh" yang mencurigakan, yang secara ajaib tumbuh menjadi pohon buah semalaman. Terpikat oleh godaan, Nyanko mengonsumsi buah tersebut, memecahnya menjadi tiga. Mencari solusi untuk keadaan Nyanko, Takashi dan teman-temannya memberi bantuan, secara tidak terduga mengungkap lebih banyak rahasia yang dimiliki kota tersebut dalam prosesnya.