Sinopsis

Cerita ini berlatar di tahun 2050 M, dan manusia telah secara bertahap memajukan teknologi antarikumnya. Namun, planet ini tiba-tiba diserang oleh musuh misterius: kekuatan Eldar, yang berasal dari 250 tahun di masa depan. Di zaman mereka, 2300 M, planet mereka Eldar diserang oleh Bumi dan kalah telak oleh Energi Trinity Bumi, energi misterius yang digunakan dalam senjata mereka yang memiliki kekuatan berkali-kali lipat dari bom hidrogen. Tujuan rakyat Eldar adalah untuk mencuri Energi Trinity ini sebelum dapat digunakan melawan mereka. Kekuatan Eldar mulai dengan menguasai bulan Io Jupiter, salah satu tempat yang telah didiami manusia pada saat itu. Setelah itu, mereka mulai menyerang Kota Trinity dengan legiun Cosmosaurus mereka untuk mencuri Energi Trinity. Toshiya dan teman-temannya menggunakan God Sigma untuk melindungi planet dan Energi Trinity, dan pertempuran ini berkembang menjadi perang yang panjang untuk merebut kembali Io.