Sinopsis

Di zaman yang lama terlupakan, ketika Bumi berada dalam jalur tabrakan dengan sebuah meteor, Pokémon Legendaris Arceus menggunakan kekuatannya untuk menghindari bahaya tersebut. Namun, pencapaian ini menyebabkan 16 Piring yang mengelilinginya tersebar di seluruh dunia. Tanpa Piring yang memberikan energi kehidupan kepada Arceus, ia mulai sekarat. Seorang manusia bernama Damon berhasil menemukan salah satu Piring dan mengembalikannya kepada Pokémon yang hampir mati itu, membantunya pulih. Sebagai imbalan, Arceus menciptakan Permata Kehidupan dan memberikannya kepada penduduk Kota Michina, dengan syarat bahwa itu harus dikembalikan, tetapi manusia menolak, menghalangi Permata itu untuk diri mereka sendiri. Dalam pertempuran yang terjadi, Damon dibunuh dan Arceus tertidur, bersumpah untuk menghukum umat manusia saat ia kembali. Satoshi dan rekan-rekannya tiba di Kota Michina di mana mereka bertemu Sheena, seorang keturunan Damon, yang mengklaim memiliki Permata Kehidupan dan berniat mengembalikannya kepada Arceus saat ia bangun. Situasinya mengambil belokan yang tidak terduga ketika Arceus, meskipun niat baik Sheena, tetap tidak puas. Satoshi sekarang harus mencegah kehancuran seluruh umat manusia, karena kemarahan Arceus menyebabkan distorsi dalam struktur alam semesta, membuat Trio Legendaris—Dialga, Palkia, dan Giratina—marah dan mengganggu keseimbangan dunia.