Sinopsis

Setelah berakhirnya MMORPG realitas virtual yang sangat populer "The World," versi baru permainan—The World R:2—diluncurkan. Pada hari pertamanya di dalam permainan, pendatang baru Haseo berpikir bahwa ia telah membuat beberapa teman untuk berpetualang. Namun, seolah-olah memperolok perasaannya, mereka membunuh karakternya hanya untuk bersenang-senang. Untungnya, ia diselamatkan oleh seorang pemain misterius dengan satu lengan bernama Ovan yang menawarkan untuk menunjukkan kepadanya tentang The World. Bersama Ovan dan temannya yang seorang pendeta, Shino, Haseo menikmati tahun pertama yang menakjubkan di dalam permainan. Namun, kehidupan damai ini hancur ketika karakter Shino dibunuh oleh sosok yang dikenal sebagai Tri-Edge, yang korbannya telah semuanya jatuh koma di dunia nyata. Dalam keadaan marah, Haseo bersumpah untuk menemukan Tri-Edge yang sulit dipahami dan membunuhnya. Berlokasi di tahun pertama Haseo di The World, .hack//Roots mengeksplorasi persahabatan yang dibangun Haseo di dalam permainan sebelum Tri-Edge merobohkannya.