Sinopsis

Setelah akhir Hakuouki, Chizuru Yukimura dan Shinsengumi terpaksa melarikan diri dari Kyoto dan berlayar ke Edo. Dalam ketidakhadiran komandan mereka Isami Kondou, wakil komandan Toshizou Hijikata mengambil alih sebagai komandan sementara. Namun, Hijikata tidak hanya berjuang dengan tanggung jawab kepemimpinan ekstra—yang mengkhawatirkan semua orang di sekitarnya—tetapi juga dengan hasrat darah yang baru ditemukan yang tidak bisa dia kendalikan. Hal ini diperparah karena dorongan itu tidak hanya memengaruhi dirinya, tetapi juga mulai membuat beberapa bawahannya menjadi gila. Akhirnya, Kondou kembali dengan perintah dari kaisar untuk mempertahankan kastil, dan nama baru untuk skuad mereka: Kouyou Chinbutai. Tetapi dalam peperangan, keseimbangan kekuasaan dapat berpindah dengan tiba-tiba dan kesetiaan dapat goyah. Dalam Hakuouki Hekketsuroku, Chizuru mengikuti Shinsengumi ke pusat peperangan dan melanjutkan pencarian ayahnya yang hilang, sementara hubungan antara dia dan Hijikata semakin kuat.