Sinopsis

Setelah setahun di Amerika, Kurisu Makise kembali ke Akihabara dan bertemu kembali dengan Rintarou Okabe. Namun, perjumpaan mereka terputus ketika Okabe mulai mengalami kilasan kembali dari garis waktu lain saat konsekuensi perjalanan waktunya mulai muncul. Efek samping ini akhirnya memuncak ketika Okabe tiba-tiba menghilang dari dunia, dan hanya Kurisu yang terkejut yang memiliki ingatan tentang keberadaannya. Di tengah keputusasaan, Kurisu dihadapkan pada pilihan yang sangat sulit yang akan menguji baik kewajibannya sebagai ilmuwan maupun kesetiaannya sebagai teman: mengikuti nasihat Okabe dan menjauh dari perjalanan waktu untuk menghindari konsekuensi yang mungkin terjadi pada garis dunia, atau mengabaikannya untuk menyelamatkan orang yang paling ia cintai. Terlepas dari keputusannya, jalan yang ia pilih adalah salah satu yang akan mempengaruhi masa lalu, masa kini, dan masa depan.