Sinopsis

A.D. 2034. Sudah dua tahun sejak Motoko Kusanagi meninggalkan Seksi 9. Togusa sekarang menjadi pemimpin baru tim, yang telah meningkat jumlah personelnya secara signifikan. Seksi 9 yang baru diperluas menghadapi serangkaian insiden rumit, dan penyelidikan mengungkapkan bahwa seorang peretas ultra-sihir bernama Puppeteer berada di balik seluruh rangkaian peristiwa ini. Di tengah semua ini, Batou, yang mengikuti kasus ini di jalur terpisah, bertemu dengan Motoko. Dia pergi setelah mengatakan, "Menjauh dari Masyarakat Solid State." Batou terjebak dalam keraguan. Apakah mungkin Motoko adalah Puppeteer? Serangkaian insiden menarik yang dihadapi Seksi 9 secara bertahap saling terkait hampir secara artistik. Siapa Puppeteer? Apa yang akan terjadi pada hubungan Batou dengan Motoko? Apa kebenaran penuh di balik kejahatan sempurna yang direncanakan dengan hati-hati ini? Dan apa hasil akhirnya? Misteri mengelilingi Masyarakat Solid State...