Sinopsis

Anak-anak Terpilih terkejut setelah pengkhianatan Meicoomon, monster digital yang baru saja bergabung dengan kelompok mereka bersama pasangan manusianya, Meiko Mochizuki. Koushirou Izumi bertekad untuk mendiagnosis infeksi yang mengendalikan Meicoomon. Sementara itu, Takeru Takaishi menyadari bahwa pasangannya sendiri, Patamon, mulai menunjukkan gejala yang mengkhawatirkan yang mirip dengan Digimon lain yang terinfeksi, seperti Meicoomon. Tiba-tiba, Anak-anak Terpilih menerima pesan dari entitas misterius Homeostasis, yang menginformasikan mereka bahwa dunia mereka dalam bahaya penghancuran total—dan Dunia Digital, rumah bagi Digimon, juga dalam bahaya. Homeostasis berencana untuk melaksanakan "Reboot," yang akan mengatur ulang semua data yang membentuk Dunia Digital dan memberantas infeksi. Namun, Reboot juga akan menghapus ingatan semua Digimon, termasuk pasangan Anak-anak. Bisakah Anak-anak Terpilih menghentikan Meicoomon sebelum Reboot menjadi perlu, atau akankah ini menjadi akhir dari waktu mereka bersama Digimon mereka?