Sinopsis

Berlokasi 30 tahun setelah peristiwa dari serial TV Youkai Watch yang asli. Dahulu ada seorang anak laki-laki berusia 11 tahun bernama Keita Amano yang memiliki jam tangan yang dapat mengendalikan Youkai, dia berteman dengan Youkai dan melakukan banyak perbuatan baik. Namun ketika anak itu dewasa, dia kehilangan kemampuannya untuk melihat Youkai. Dan mengenai jam tangan yang dapat mengendalikan Youkai, keberadaannya mengancam keseimbangan antara dunia manusia dan Youkai, sehingga ditinggalkan ke dalam kegelapan di luar waktu dan ruang. Tak lama kemudian... kisah jam tangan pengendali Youkai pun hanya menjadi legenda. Tapi kemudian, sesuatu terjadi setelah bertahun-tahun berlalu... sebuah epidemi virus Youkai yang dikenal sebagai Onimaro mulai mempengaruhi orang-orang dengan niat jahat dan menyebar tanpa henti, mengubah mereka menjadi Kaodeka Oni dan menyebabkan kekacauan di seluruh kota. Dengan akhir yang dekat, hanya mereka yang dipilih oleh Youkai Watch baru yang dapat melawan ancaman yang akan datang dan menyelamatkan baik Youkai maupun manusia dari kehancuran yang pasti.