Sinopsis

Untuk melindungi kedamaian dan keamanan Jepang dari Makhluk Raksasa Misterius, "Robot Transformasi Shinkansen Shinkalions" dikembangkan oleh Institut Evolusi Ultra Shinkansen. Dalam persiapan menghadapi serangan musuh baru, Institut Evolusi Ultra sedang mengembangkan jenis robot baru yang disebut "Shinkalion Z" serta kendaraan penguat bersenjata baru yang disebut "Zailiners" yang bertransformasi dari kereta konvensional untuk memperkuat "Shinkalion Z". Anak-anak yang menjadi pengemudi "Shinkalion Z" dengan tingkat kompatibilitas tinggi akan bekerja sama dengan anggota staf institut untuk menghadapi monster raksasa yang muncul kembali. Kemunculan musuh yang tidak dikenal - Dan pertemuan dua anak laki-laki.