Описание

Год 2148. Два года после окончания оригинального аниме «Фафнер в лазурном». Остров Тацумия и его выжившие жители вернулись к какому-то подобию восстановления. Однако для нашего героя, Казуки, всё стало безнадежным: он почти слеп и частично парализован после сражений с Фестум два года назад. Он крепится к обещанию, которое дал ему его павший друг Сōси — вернуться на остров и всё исправить. Надежды Казуки вспыхивают, когда в беспилотной подводной лодке, плавающей в бухте Тацумия одной ночью, обнаруживается жизненная форма; однако на борту не Сōси, а загадочный «мальчик» по имени Мисао Курсу, который может быть не совсем человеком и утверждает, что был отправлен Сōси. С прибытием Мисао конфликты снова вспыхивают между Человеческой Армией и Фестум, и пилоты Фафнера оказываются втянутыми в самую отчаянную битву в своей жизни — на этот раз судьба ДВУХ рас лежит на их плечах.