Özet

Madoka Kaname ve en yakın arkadaşı Sayaka Miki, Mitakihara şehrinde sıradan ortaokul öğrencileridir. Ancak bir gün, onlara bir dilek verebileceğini iddia eden Kyuubey adında garip bir kedi benzeri yaratıkla karşılaşırlar. Bunun karşılığında, sihirli kız olmayı ve cadıların işlediği kötülüklere karşı savaşmayı kabul edeceklerdir. Bölgedeki deneyimli bir sihirli kız olan Mami Tomoe, onlara cadıları avlamayı öğretmeye karar verirken, gizemli transfer öğrencisi Homura Akemi, Kyuubey'in teklifini kabul etmemeleri konusunda uyarır, ancak nedenini söylemeyi reddeder. Ancak, cadılarla savaşmanın acımasız gerçeğini gördükten sonra, kızlar Kyuubey'in teklifini reddetmenin daha güvenli olabileceğine karar verir. Fakat şehre başka bir sihirli kız geldiğinde ve Sayaka sevdiği kişiye yardımcı olmak için bir dilek yapmaya karar verdiğinde, işler hızla karmaşıklaşır ve güçlerinin arkasındaki sert gerçek ve dileklerinin nihai bedeli ile yüzleşmek zorunda kalırlar.