Özet

Daha önce Lumiose Şehri Profesörü Platane'nin asistanı olan Alain ve Lizardon, mega evrim güçlerini ustalaşarak daha da güçlü olmak için bir yolculuğa çıkıyor. Bu fenomenin gizemlerini araştırmak için gizemli Fleur-de-lis'in isteği üzerine, Alain ve Lizardon, Kalos ve Hoenn'i geçerek mega evrimi kullanabilen yetenekli eğitmenleri arıyorlar ve Fleur-de-lis'in araştırmasına yardımcı oluyorlar. Yolculukları sırasında Harimaron'u ile birlikte ona katılmaya karar veren Manon adında genç bir kızla tanışıyorlar ve Alain bu duruma isteksizce onay veriyor. Pokemon XY: Mega Evrim, Alain ve Lizardon'un mega evrimin en güçlü kullanıcıları olma yolundaki macerasını takip ederken, aynı zamanda Fleur-de-lis'in hırslarını ve ona en önemli olanların güvenliğini korumak için efsanevi canavarlara karşı da savaşır.