Özet

Bir altın balığı evden kaçıp bir denizanasının sırtında süzülür. Bir cam kavanoza sıkıştıktan sonra, sahile drift eder ve burada annesi Lisa ile deniz kenarındaki bir evde yaşayan beş yaşındaki Sousuke tarafından kurtarılır; babası Koichi bir balıkçı teknesinde çalışmaktadır. Sousuke'un parmağındaki kesiyi yalayarak iyileştirdikten sonra, altın balık yeni arkadaşı tarafından Ponyo olarak adlandırılır. Sousuke'a bilinmeyen bir şekilde, Ponyo’nun zaten bir adı ve ailesi vardır. İnsanlığını terk edip su altında yaşamayı tercih eden bir sihirbaz olan babası Fujimoto, kızı Brunhilde'i çılgınca arar. Bulunduğunda ve yakalandığında, Ponyo doğum adını reddeder ve insan olmak istediğini ilan eder. Sousuke'un kanından aldığı güçle kolları ve bacakları büyür ve bir kez daha yüzeye kaçar. Ancak okyanusa salinan sihir, doğada dengesizlik yaratır; Ay’ın yörüngeden düşmeye başlaması ve gelgitlerin tehlikeli biçimde güçlenmesi gibi sonuçlar doğurur. Ponyo ile yeniden bir araya gelen Sousuke, dünyada düzeni sağlamak ve arkadaşının insan olarak devam etmesini sağlamak için eski bir testi geçmek zorundadır.