Özet

2015 yılında Chaldea Güvenlik Örgütü, insanlığın olası yok olma olaylarını gözlemlemek için hem sihirsel hem de sıradan alanlardan uzmanları bir araya getirir. İnsanlığın hayatta kalması, önümüzdeki yüzyıl için güvence altına alınmış gibi görünmektedir—ta ki hüküm aniden değişene kadar ve şimdi 2016'nın sonunda türün yok edilmesi beklenmektedir. Sebebi bilinmemektedir, ancak Japonya'nın Fuyuki kasabasıyla ve 2004 yılında Beşinci Kutsal Kupa Savaşı sırasında yaşanan olaylarla bağlantılı gibi gözükmektedir. Bu duruma yanıt olarak Chaldea, zaman yolculuğuna yönelik deneysel bir yöntem olan Rayshift teknolojisini kullanır. Bu teknoloji ile, organizasyona yeni dahil olan genç adam Ritsuka Fujimaru ve gizemli kız Mash Kyrielight, 2004 yılına geri seyahat ederek insanlığı nasıl kurtaracaklarını keşfedebilirler. Kaderle savaşmak için büyük bir emir ilan edilmiştir—geçmişi değiştirmek ve geleceği geri kazanmak için bir emir.