Özet

Medaka Kurokami, kelimenin tam anlamıyla mükemmeldir. Güzel, zeki ve atletik olan Medaka'nın hayali başkalarını mutlu etmektir. Bu yüzden prestijli Hakoniwa Akademisi'nde Öğrenci Konseyi Başkanı için aday olduğunda, %98 oyla seçimi kazanması beklenir. İhtişamlı yeni başkanın yaptığı ilk şey, öğrencilerin herhangi bir yardım talebi gönderebileceği "Medaka Kutusu"nu kurmaktır. Çocukluk arkadaşı ve ona yardım etmeye zorlanan alaycı Zenkichi Hitoyoshi ile birlikte, Medaka bu talepleri oldukça hızlı bir şekilde yerine getirir. Tamamlanan her görev için öğrenci konseyi odasına çiçek ekler ve tüm okulu doldurma hedefindedir. Ancak, ikili başkalarına yardım etmenin düşündüklerinden çok daha zor olabileceğini fark etmeye başlarlar; çünkü akademiyi ve hatta Medaka'nın kendisini merkezine alan yıkıcı bir planı ortaya çıkarmaya başlarlar!