Özet

Yüz yıl önceki yıkıcı tektonik plaka kaymaları, Japonya'nın büyük bir kısmının sulara gömülmesine neden olduktan sonra, Japonya artık bir deniz ulusu olarak gelişiyor. Yüksek işlevsel şehirler Japonya'nın kıyılarını sıralarken, iyi gelişmiş deniz yolları özel deniz gemileri tarafından savunuluyor. Deniz endüstrisi hızla büyüyor ve genç kızlar denizleri korumaya adamış yüksek becerili kadınlar olan Mavi Deniz Kızları'na katılmak için hevesle bekliyorlar. Ayrı kaldıktan bir süre sonra, çocukluk arkadaşları Akeno Misaki ve Moeka China Yokosuka Kızlar Deniz Lisesi'nde yeniden bir araya geliyor. Burada, Mavi Deniz Kızları olma hayalini paylaşan diğerleriyle bir araya geliyorlar. Kısa sürede eğitim alıştırmaları başlıyor ve Akeno ile Moeka kendi gemileri ve mürettebatlarıyla görevlendiriliyor. Akeno, kaptanlık rolüne girmeye başladıkça ve Harekaze isimli muhrip gemisindeki mürettebat üyeleriyle dostluk ilişkisi geliştirmeye başladıkça her şey sorunsuz ilerliyor. Ancak, beklenmedik motor ve navigasyon arızaları, gemilerini mahsur bırakıyor ve mürettebatı tehlikeye atıyor. High School Fleet, Harekaze'nin cesur mürettebatının, Mavi Deniz Kızları olma yolundaki tehlikeli sularda ve diğer engellerde mücadelelerini takip ediyor.