Özet

Harukanaru Toki no Naka de 2'nin bitiminden sonra 100 yıl daha geçti (ilk anime sonrası 200 yıl). Geçmişte az bir zaman geçmesine rağmen, gelecekte çok az zaman geçti. Bir gün, Kasuga Nozomi, lisesinde tuhaf bir çocukla karşılaşır. Bu çocuk onu zaman ve mekân boyunca Kyou'ya, Heian döneminin sonlarına doğru Kyoto'ya çok benzeyen bir başka dünyaya gönderir. Orada Minamoto klanı ("Genji"), Minamoto no Yoritomo liderliğinde Taira klanına ("Heike") karşı savaş halindedir. Heike, intikam peşinde koşan ruhları serbest bırakarak Genji'yi yenmeyi umar; böylece dünyanın doğal enerji akışını bozup toprağı terörize ederler. Çocuk, Kyou'yu koruyan Beyaz Ejderha Tanrısı Hakuryuu'nun insan formu olduğu ortaya çıkar ve intikam peşindeki ruhların varlığı nedeniyle zayıflamıştır. Hakuryuu no Miko (Beyaz Ejderha Tanrısı'nın Rahibesi) olarak Nozomi, Hakuryuu'nun gücü restoredilene kadar onu evine gönderemeyeceği için Genji ile birleşir...