Özet

2025 yılında, Kikou adı verilen otomatonlar aniden ortaya çıkar ve insanoğluna saldırır, birçok şehri tamamen harabe bırakır. İnsan medeniyeti yıkım içinde kalır, ancak Japonya'da bir Kikou kalıntısı bulunur. Kikou'nun silahlarını araştırmak için Tokyo Kikou Enstitüsü (Toukigen) adında bir araştırma tesisi kurulmuştur. 'Zehirle zehiri yen' atasözünü takip eden bu yöntemde, Kikou'yu yenmek için Kikou kullanmak, insanlığın son umudu gibi görünmektedir. Dokuz yıl sonra, araştırmalardan elde edilen yeni bir silah olan Muttsu geliştirilir ve çok yakında gerçek savaşta kullanılmak üzere hazır hale gelir. Bir çocuk olan Rin Sagami ve bir kız olan Yuzuru Midou, Muttsu'yu kullanmak üzere seçilir. Gelecek için insanlığın umutları onlara emanet edilmiştir, ancak bu göreve cesaretle yaklaşırlar. Fakat ikisini bekleyen, acımasız bir kaderdir.