Özet

Elli yıl önce, "Büyük" olarak bilinen gizemli varlıklar tüm dünyada aniden belirdi ve insanlık için varoluşsal bir tehdit oluşturdular. Bu tehditlere karşı savunma yapmak için, "Lilies" olarak bilinen ergen kızlardan oluşan askerler, bedenlerindeki "Magie" enerjisini kullanarak "Counter Huge ARMS" veya "CHARMS" adlı silahları güçlendiriyorlar. İki yıl önce, bir Büyük saldırısında tahliye olurken bir Lily tarafından kurtarılan Riri Hitotsuyanagi, kendisinin de bir Lily olacağına yemin etti. Lilies'in eğitim alanı olan Yurigaoka'nın prestijli akademisine kaydolur ve sınıf arkadaşlarından birinin onu kurtaran aynı Lily, Yuyu Shirai olduğunu keşfeder. Ancak, neşeli olduğunu düşündüğü kişinin oldukça asosyal olduğu ve yalnız savaşmayı tercih ettiği için oldukça kafası karışır. Yine de, Riri Yuyu ile iyi geçinmek istiyor ve bu amaç uğruna elinden geleni yapmaya istekli.