Özet

"Gülen Adam" davasının kapanmasının ardından, Japonya'nın yeni seçilen Başbakanı Youko Kayabuki tarafından Section 9, siber terörizm tehdidiyle mücadele etmek için yeniden kuruldu. "Bireysel Onbir" adını taşıyan bir grup, Japonya genelinde terör eylemleri gerçekleştirmeye başladı. Motoko Kusanagi, Daisuke Aramaki, Batou ve Section 9'un diğer üyeleri bu yeni tehdit üzerinde araştırma yaparken, Japon hükümeti başka bir krizle karşı karşıya kalıyor; Üçüncü Dünya Savaşı'nda yerinden edilen yabancı mülteciler Japonya'da sığınma talep ediyor. Ancak, özel operasyon ekibi, avları sırasında sürekli olarak Kabine İstihbarat Servisi'nin önde gelen bir üyesi Gouda Kazundo ile karşılaşınca, onun bu işin içinde olabileceğinden şüphelenmeye başlıyorlar ve mülteci krizi ile Bireysel Onbir arasındaki olayların düşündüklerinden daha bağlantılı olabileceğini fark ediyorlar...