Sinopsis

Pada tahun 0096 Abad Universal, perdamaian yang rapuh muncul dari abu konflik. Siswa berusia enam belas tahun, Banagher Links, mengunjungi koloni luar angkasa Industrial 7 dalam perjalanan sekolah, namun karena shuttlenya yang rusak, ia terjebak sepenuhnya. Bagi Banagher, yang selalu hidup normal, perang selalu menjadi bagian sejarah yang jauh dan hampir mitos; tetapi dalam hitungan menit, fantasi menjadi kenyataan ketika ia menyelamatkan seorang gadis bernama Audrey Burne, yang sangat perlu bertemu dengan pemimpin Yayasan Vist terdekat, Cardeas Vist. Dia berharap dapat meyakinkannya untuk menahan "Kotak Laplace," sebuah objek yang memiliki potensi untuk menghancurkan dunia. Sejarah mulai bergerak ketika kekuatan galaksi berkumpul di Industrial 7, masing-masing bersaing untuk menguasai Kotak Laplace. Saat sisa-sisa Neo Zeon bertabrakan dengan Angkatan Bersenjata Federasi Bumi di sekitar koloni, Cardeas, di saat-saat terakhirnya, memberikan Banagher kunci untuk Kotak tersebut, sebuah mobile suit yang disebut "The Unicorn Gundam." Dipenuhi dengan aksi yang meledak-ledak dan ketegangan yang meningkat, Mobile Suit Gundam Unicorn RE:0096 mengikuti Banagher saat keyakinannya diuji dan takdir yang terpendam selama lebih dari satu abad akhirnya terwujud.