Sinopsis

Pada tahun Universal Century 0096, tiga tahun setelah upaya gagal Char Aznable untuk memaksa migrasi manusia ke luar angkasa, kehidupan terus berlanjut di koloni-koloni yang mengelilingi Bumi. Salah satu koloni tersebut, di Side 4, adalah rumah bagi Banagher Links, seorang remaja berusia 16 tahun yang hidup tenang di antara teman-teman sekelasnya. Audrey Burne, keturunan terakhir dari keluarga tiran besar, mengambil tanggung jawab untuk mencuri kunci dari perangkat misterius yang dikenal sebagai "Kotak Laplace." Dikatakan bahwa Kotak tersebut memiliki kekuatan untuk membentuk arah alam semesta, dan Audrey melakukan perjalanan ke Side 4 dalam upaya untuk mengambilnya dari pemiliknya saat ini dan mencegahnya jatuh ke tangan Sleeves, sisa-sisa yang selamat dari Neo-Zeon milik Char Aznable. Dalam pencariannya, dia bertemu Banagher dan mengubah hidupnya selamanya. Ketika Side 4 diserang oleh Sleeves dan para petarung ulungnya Marida Cruz dan Full Frontal, Banagher mengendalikan Gundam Unicorn yang baru dibangun untuk melindungi teman-temannya dan melindungi nasib umat manusia.