Özet

Tetsurou Hoshino, annesinin katilinin, makine adam Kont Mecha'nın intikamını almak için ölümsüz bir mekanik bedene sahip olmayı arzulayan bir çocuktur. Ancak, aradığı şeye ulaşmanın inanılmaz maliyeti nedeniyle tek umudu, galaksinin etrafında seyahat eden ve son durakları metal ikamelerin bedava sağlandığı bir gezegen olan Galaxy Express 999'un biniş kartını çalmaktır. Bir geçiş kartını kaptıktan sonra, Tetsurou polisin peşine düşmesiyle, annesine çok benzeyen gizemli bir kadın olan Maetel'in kollarında yere yığılır. Uyandığında, kadını, 999'a giriş yapmasını sağlayacağına, eğer onunla seyahat etmeyi kabul ederse, söyler. Teklifini kabul eden Tetsurou, Maetel ile kozmik demiryolu yolculuğuna çıkar ve galaksiyi keşfetmeye başlar.